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博士生导师
科学研究
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孙艳波
作者: 来源: 发布时间 : 2020-07-20 03:25:06 点击量:


一、个人信息

姓名:孙艳波

职称:研究员;博士生导师

通讯地址:学院(呈贡校区)yl6809永利/生物多样性研究院

邮件地址:biosunyb@163.comsunyanbo@ynu.edu.cn

Github链接:https://github.com/Sun-Yanbo

ResearchGate链接:https://www.researchgate.net/profile/Yan-Bo-Sun

国家万人计划青年拔尖人才入选者,云南省杰青/中青年学术和技术带头人,曾主持多项国家自然科学基金,云南省基础研究专项,中科学院战略先到项目等,并在本领域杂志(如PNASMol Biol EvolBioinformaticsGenome Biol EvolGenome Research等)发表20余篇论文。

主要从事动物生态适应的遗传机制研究,利用进化基因组学和群体遗传学来系统探讨基因型和表型的关系,从而阐明生物对历史环境的生态适应机制,以及不同遗传元件(转座子、调控区、编码区等)在适应性进化中的交互作用,进而在基因组层面评估生物对未来环境(尤其是全球变化背景下)的适应潜力和演化方向。主要研究领域包括(1)动物关键生活史性状的形成和演化机制;(2)动物表型可塑性的形成机制及其与适应性进化的关系;(3)全球变化下的群体基因组学研究;(4)动物的线粒体基因组进化。

 

二、教育经历

2007/09-2012/06,中国科学院,昆明动物研究所硕博连读,遗传学/博士

2003/09-2007/06山东大学海洋学院生物科学/学士

 

三、工作经历

2020/04-至今,云南大学,yl6809永利/生物多样性研究院研究员

2015/01-2020/04,中国科学院昆明动物研究所/两栖爬行多样性与进化,副研究员

2012/07-2014/12,中国科学院昆明动物研究所/两栖爬行多样性与进化,助理研究员

 

、科研项目

1. 国家“万人计划”青年拔尖人才,2023/01-2025/12,在研,主持

2. 国家重点研发计划,“全球变化对中国陆生生物多样性的影响及风险评估”子课题,2023/07-2028/06在研,主持

3. 云南省基础研究计划“杰出青年”项目,表型可塑性与适应性进化的相关性研究,2021/04-2024/03在研,主持

4. 学院高层次引进人才项目,生态学,2020/05-2023/05在研,主持

5. 国家自然科学基金面上项目,转座元件介导的表观调控和序列变异在动物低氧适应中的作用,2019/01-2022/12在研,主持

6. 国家自然科学基金面上项目,高原蛙类的紫外应答机制及其抗氧化系统的适应性进化研究》,2017/01-2020/12已结题,主持

7. 国家自然科学基金青年基金,人脑不同功能区域的转录组复杂度及其调控机制研究》,2014/01-2016/12已结题,主持

8. 中国科学院“西部青年学者”,胎生蜥蜴的进化机制解析,2019/01-2021/12已结题,主持

9. 中国科学院,青年创新促进会2017/01-2020/12已结题,主持

 

代表性成果

(1)     Zuo, B., Nneji, L.M. & Sun, YB*. Comparative genomics reveals insights into anuran genome size evolution. 2023. BMC Genomics 24, 379.

(2)     Fu T.T#, Sun Y.B#, Gao W#, Long C, Yang C, Yang X, Zhang Y, Lan X, Huang S, Jin J, Murphy R, Zhang Y*, Lai R*, Hillis D*, Zhang Y.P*, Che J*. 2022 The highest-elevation frog provides insights into mechanisms and evolution of defenses against high ultraviolet radiation. PNAS 119 (46) e2212406119

(3)     Liu YN, Chen RM, Pu QT, Nneji LM, Sun YB*. 2022. Expression Plasticity of Transposable Elements Is Highly Associated with Organismal Re-adaptation to Ancestral Environments. Genome Biology and Evolution 14 evac084.

(4)     Yan-Bo Sun*, Yi Zhang, Kai Wang. 2020, Perspectives on studying molecular adaptations of amphibians in the genomic era. Zoological Research, 41(4): 351-364.

(5)     Chun-Hua Yang, Ting-Ting Fu, Xin-Qiang Lan, Yun Zhang, Lotanna Micah Nneji, Robert W. Murphy, Yan-Bo Sun*, Jing Che* 2019. Comparative skin histology of frogs reveals high-elevation adaptation of the Tibetan Nanorana parkeri. Asian Herpetological Research 10(2): 7985.

(6)     Gao, W.#, Sun, Y.B.#, Zhou, W.W.#, Xiong, Z.J., Chen, L., Li, H., Fu, T.T., Xu, K., Xu, W., Ma, L., Chen, Y.J., Xiang, X.Y., Zhou, L., Zeng, T., Zhang, S., Jin, J.Q., Chen, H.M., Zhang, G., Hillis, D.M., Ji, X., Zhang, Y.P., Che, J., 2019. Genomic and transcriptomic investigations of the evolutionary transition from oviparity to viviparity. PNAS 116, 3646-3655.

(7)     Sun, Y.B., Fu, T.T., Jin, J.Q., Murphy, R.W., Hillis, D.M., Zhang, Y.P., Che, J., 2018. Species groups distributed across elevational gradients reveal convergent and continuous genetic adaptation to high elevations. PNAS 115, E10634-E10641.

(8)     Sun, Y.B., 2018. FasParser2: a graphical platform for batch manipulation of tremendous amount of sequence data. Bioinformatics 34, 2493-2495.

(9)     Jin, J.Q., Sun, Y.B.*, 2018. AutoSeqMan: batch assembly of contigs for Sanger sequences. Zoological Research 39, 123-126.

(10) Sun, Y.B*., 2017. FasParser: a package for manipulating sequence data. Zoological Research 38, 110-112 .

(11) Sun, Y.B., Xiong, Z.J., Xiang, X.Y., Liu, S.P., Zhou, W.W., Tu, X.L., Zhong, L., Wang, L., Wu, D.D., Zhang, B.L., Zhu, C.L., Yang, M.M., Chen, H.M., Li, F., Zhou, L., Feng, S.H., Huang, C., Zhang, G.J., Irwin, D., Hillis, D.M., Murphy, R.W., Yang, H.M., Che, J., Wang, J., Zhang, Y.P., 2015. Whole-genome sequence of the Tibetan frog Nanorana parkeri and the comparative evolution of tetrapod genomes. PNAS 112, E1257-1262.

(12) Wu, D.D., Ye, L.Q., Li, Y., Sun, Y.B., Shao, Y., Chen, C., Zhu, Z., Zhong, L., Wang, L., Irwin, D.M., Zhang, Y.E., Zhang, Y.P., 2015. Integrative analyses of RNA editing, alternative splicing, and expression of young genes in human brain transcriptome by deep RNA sequencing. Journal of molecular cell biology 7, 314-325.

(13) Sun, Y.B., Zhou, W.P., Liu, H.Q., Irwin, D.M., Shen, Y.Y., Zhang, Y.P., 2013. Genome-wide scans for candidate genes involved in the aquatic adaptation of dolphins. Genome biology and evolution 5, 130-139.

(14) Liu, J.#, Wang, L.D.#, Sun, Y.B.#, Li, E.M., Xu, L.Y., Zhang, Y.P., Yao, Y.G., Kong, Q.P., 2012. Deciphering the signature of selective constraints on cancerous mitochondrial genome. Molecular biology and evolution 29, 1255-1261.

(15) Sun, Y.B., Shen, Y.Y., Irwin, D.M., Zhang, Y.P., 2011. Evaluating the roles of energetic functional constraints on teleost mitochondrial-encoded protein evolution. Molecular biology and evolution 28, 39-44.

 

、招生要求

招收专业:生态学(博士、硕士)

欢迎有志于从事动物分子进化/生态/景观基因组学研究的同学、及从事相关领域博士后研究的博士毕业生加入我们团队。


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